Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms