Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IHHQ14623 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IHHQ14623 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IHHQ14623 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms