Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HSPB3Q12988 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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