Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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