Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms