Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms