Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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