Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms