Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1P21675 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1P21675 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms