Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMNB1P20700 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms