Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms