Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4FO95754 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms