Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC11O43248 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms