Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms