Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDGFDQ9GZP0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms