Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZBED2Q9BTP6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms