Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDCCAG3Q96C92 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms