Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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