Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms