Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC38Q5VT99 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms