Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA1Q15788 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA1Q15788 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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