Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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