Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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MKRN4PQ13434 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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