Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4BQ07343 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms