Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms