Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms