Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA4P51532 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms