Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCT8P50990 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms