Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms