Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBP1P32455 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms