Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDGFRAP16234 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms