Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIEO00221 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms