Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP17L13C9JLJ4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L13C9JLJ4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms