Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms