Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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COPS7AQ9UBW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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COPS7AQ9UBW8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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COPS7AQ9UBW8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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COPS7AQ9UBW8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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COPS7AQ9UBW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
COPS7AQ9UBW8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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