Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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VAPAQ9P0L0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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