Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms