Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TREX2Q9BQ50 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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