Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRAMD4Q6IC98 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms