Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms