Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms