Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMAD4Q13485 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms