Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME3Q13232 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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