Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms