Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTLA4P16410 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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