Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEFHP12036 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEFHP12036 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms