Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms