Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYNGR2O43760 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYNGR2O43760 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms