Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP4E1Q9UPM8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP4E1Q9UPM8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms