Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms